云南中醫藥大學成立于1960年，是全國第二批成立的高等中醫藥本科院校，1986年獲碩士學位授予權，2007年獲教育部本科教學工作水平評估“優秀”，2013年、2015年中醫學、中藥學專業先后通過教育部認證，2016年成為云南省人民政府與國家中醫藥管理局共建高校，2017年通過教育部本科教學審核評估，2018年成為博士學位授予單位，更名為云南中醫藥大學，成為國家中醫藥臨床研究基地。學校秉承“崇德和合，博學敦行”的校訓精神，已發展成為以中醫藥為主體、民族醫藥為特色，以本科教育為基礎，研究生教育規模不斷擴大，對外教育呈現良好態勢，醫、理、工、管多學科協調發展的綜合性中醫藥院校。
截至2019年04月，學校有全日制學生11342人。其中，本科生9951人，碩士研究生1159人，學歷教育留學生232人。有11個二級學院、1個公共課教學部。有17個國家中醫藥管理局重點學科、14個省級重點學科，1個中醫學一級學科博士學位授權點，4個一級學科（涵蓋28個二級學科）碩士點，4個專業碩士學位點。有27個本科專業，其中，2個國家級特色專業、1個國家級綜合改革試點專業，3個省級綜合改革試點專業，5個省級特色專業，2個云南八大重點產業引領品牌專業，200余項省級及以上教學質量工程項目。有實踐教學基地140余個，其中，直屬附屬醫院2所，非直屬附屬醫院14所。現有紙本藏書980596冊，紙質期刊384種，館藏線裝古籍圖書1.8萬冊，電子資源總量61.78TB，擁有中外文數據庫51個，電子圖書323萬冊（鏡像42萬冊，遠程使用103萬冊），是國家教育信息化試點單位。
校本部有教職工741人,學歷、學緣、職稱結構合理。有博士研究生導師17人，享受國務院政府特殊津貼專家7人，首屆全國名中醫1人，國家衛計委突出貢獻中青年專家1人，全國中醫藥高校教學名師1人，省級教學名師8人；云南省千人計劃云嶺青年人才1人；云南省萬人計劃云嶺學者1人、名醫專項10人，產業技術領軍人才1人、文化名家1人、青年拔尖人才9人；云南省突出貢獻優秀專業技術人才12人、教學名師9人；云南省國醫名師4人、名中醫36人、榮譽名中醫33人；享受云南省政府特殊津貼專家12人，云南省中青年學術和技術帶頭人12人、后備人才5人；技術創新人才2人，培養對象2人；首批云南省中醫藥領軍人才3人、中醫藥高層次人才及培養對象2人。聘請420余名國內外知名教授和專家擔任碩士生導師、名譽校長、客座教授、名譽教授。
59年來，幾代名醫名家傾囊相授，潛心育人，培養了6萬余名中醫藥專門人才，有的植根云嶺，造福桑梓，有的遠涉重洋，光大中醫，涌現出國家科技進步一等獎、何梁何利獎獲得者朱兆云；旅法中醫專家、時空針灸創始人、法國榮譽軍團騎士勛章獲得者朱勉生；軍中國醫名師寧亞功；中國中醫科學院首席研究員、廣安門醫院院長王階；全國民族團結進步先進個人陳本善；中國人民大學教授、教育部高校思想政治理論課教師、2014年度影響力標兵人物王向明等一大批享譽國內外的杰出校友。
學校聚焦民族醫藥、滇南醫藥、南藥研究三大科研集群，有省級重點實驗室、工程技術研究中心、中醫藥臨床評價研究中心，工程實驗室、公共科技服務平臺各1個，省級創新團隊2個，有國家中醫藥管理局中醫藥科研三級實驗室2個，院士專家工作站9個，院士工作站站點1個，省級2011協同創新中心2個，省級中醫臨床研究基地1個，省哲學社會科學研究基地1個，省技術轉移示范機構1個，省高校重點實驗室和工程中心8個，省高校科技創新團隊5個。學校學報為中國科技核心期刊。
推進校政、校校、校地、校企合作，打造“保健品化妝品第三方檢測、臨床評價研究、健康產品研發、中醫藥知識產權戰略運營中心”四大平臺，彌補云南生物醫藥和大健康產業科研平臺短板。與省藥監局共建云南省中醫藥產業發展研究院、與省科技廳共同設立“中醫藥聯合專項基金”，是云南省中醫藥政策研究中心，中國中醫科學院中醫藥數據中心云南分中心、云南省中醫藥數據中心，云南省民族醫藥保護與產業發展研究基地。
建有世界唯一的中醫西學博物館；2017年7月，國家漢辦批準設立“孔子學院總部國際（西學）中醫文化推廣研究基地”。建有云南省中醫藥民族醫藥博物館，是國家中醫藥文化宣傳教育基地、云南省科普教育基地。
早在1990年就代表中國與西班牙合作辦學，建立了“加泰羅尼亞-云南中醫學院”，被載入全國中醫藥高等教育60年史冊。從2007年發起并主辦八屆“大湄公河次區域傳統醫藥交流會”；2015年在老撾開設“中醫教育培訓中心”；2016年成立“瀾滄江—湄公河傳統醫藥學院”，舉辦首屆瀾滄江—湄公河傳統醫藥學術交流暨首屆國際佤醫藥發展交流會；2017年獲批“中國-緬甸中醫藥中心” ；2018年承辦首屆國際哈尼醫藥發展交流會。在中醫西學研究方面獨樹一幟，已連續舉辦五屆中醫西學國際論壇，為“中華文化走出去”提供了有益的借鑒。學校先后與美國、澳大利亞、法國、德國、加拿大、瑞士、韓國、泰國、越南、印尼及港臺等30多個國家或地區建立了交流合作關系，是云南省中醫藥國際教育基地、國際科技合作基地，已成為南亞東南亞區域最有影響力的國際傳統醫藥教育交流合作平臺。
欣逢盛世，中醫藥迎來了天時、地利、人和的大好發展時機。中醫藥上升為國家戰略，云南省將生物醫藥和大健康產業列為八大重點推進產業之首，打造“綠色能源”“綠色食品”“健康生活目的地”三張牌，昆明被批準設立國家級大健康產業示范區、建設國家植物博物館。學校將順勢而上、乘勢而為，主動融入“一帶一路”倡議、健康中國等國家戰略，圍繞云南三大戰略定位，為云南經濟社會發展服務，推進特色鮮明高水平中醫藥大學建設。
