長春中醫藥大學藥學院是吉林省中藥學、藥學類高級專門人才培養基地。其前身中藥系是復校后1980年首建兩大系之一。1959年設中藥學專業，1978年始招本科生。現有1個一級學科（中藥學）博士后科研流動站和博士學位授權點，2個一級學科（中藥學、藥學）碩士學位授權點和碩士專業學位授權點，18個二級學科碩士學位授權點，9個本科專業和專業方向，其中中藥學專業為國家級特色專業，中藥學“兩段雙向型”人才培養模式被評為國家級人才培養模式創新實驗區。制藥工程專業、藥學專業、藥物制劑專業為省級特色專業。自2011年級開始開設制藥工程卓越工程師班。
藥學院現設有10個教研室，1個實驗教學中心。現有教職工109人，其中教授18人，副教授26人，高級實驗師5人，學科共有博士研究生導師15人、碩士研究生導師62人。在校生包括博士、碩士和本科生2300余人。
承擔全國規劃、統編、創新教材51部，主編單位15部，副主編單位32部。取得省級精品課程5門（中藥藥理學、中藥藥物分析學、中藥鑒定學、藥劑學、中藥藥劑學）。2007年評為吉林省省屬高校首批實驗教學示范中心。中藥實驗教學團隊和中藥學“兩段雙向型”人才培養創新團隊被評為省級優秀教學團隊。學院建有“七星百草園”生藥學實踐教學基地；同時與省內外18個醫藥企事業單位建立穩定的實踐教學基地，作為國家級大學生創新創業訓練基地，承擔國家和省大學生創新創業訓練項目46項。取得省優秀教學成果一等獎3項，二等獎2項，三等獎1項，校級獎8項。
共承擔科研課題123項，教研課題22項，其中國家“973”、863、自然科學基金、重大新藥創制及國家各部委項目18項。取得省部級以上科研成果53項，其中科技進步獎23項，有4項在國際獲獎。32項被應用或轉讓生產。如新藥鎮腦寧自1992年投放市場以來，產值已超過30億元人民幣,有2項成果被《中國藥典》（2005年版）收錄，為吉林省地方經濟做出了巨大貢獻。
50余年來培養各級各類藥學人才6000余人。絕大多數都已成為藥學事業的骨干。他們中有國內外知名的藥學專家，有被譽為“蔣筑英”式青年科技工作者的模范共青團員，有國家各級政府、醫藥企事業單位的領導。近五年學生就業率均在93%以上，且供不應求。
與日本靜岡大學、三重大學、京都大學、星藥科大學、韓國世明大學、泰國朱拉大學等建立了互派留學生和高級訪問學者等合作關系。
藥學院秉承“啟古納今，厚德精術”的辦學理念，以教學為中心，以科研為先導，團結、求實、創新。突出優勢，加強重點、特色學科專業建設，造就一代中藥及藥學事業的創新人才。在中藥現代化產業基地建設以及地方經濟建設中發揮主力軍作用。我們期待著同各方友人，攜手同心，共創新世紀的輝煌！
